Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms