Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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