Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms