Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FarsaQ8C0C7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms