Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmod1Q8BVA4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms