Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms