Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms