Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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