Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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