Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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H2-M10.2Q85ZW9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.2Q85ZW9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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H2-M10.2Q85ZW9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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H2-M10.2Q85ZW9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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