Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

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Length 1,560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnnQ80Z71 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnnQ80Z71 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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