Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms