Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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