Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms