Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrkhQ80VL1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms