Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NischQ80TM9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
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