Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms