Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms