Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd1cQ76I25 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms