Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RfflQ6ZQM0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RfflQ6ZQM0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RfflQ6ZQM0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RfflQ6ZQM0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RfflQ6ZQM0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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