Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d2Q6PHS9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms