Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vstm2lQ6PDS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vstm2lQ6PDS0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vstm2lQ6PDS0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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