Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms