Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms