Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23ipQ6NZC7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms