Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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