Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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