Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms