Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms