Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms