Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms