Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms