Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms