Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhocQ62159 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms