Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CttnQ60598 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms