Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms