Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms