Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms