Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmprss11eQ5S248 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmprss11eQ5S248 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms