Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PkdccQ5RJI4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PkdccQ5RJI4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PkdccQ5RJI4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PkdccQ5RJI4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PkdccQ5RJI4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PkdccQ5RJI4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PkdccQ5RJI4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms