Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms