Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms