Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms