Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8bQ5DU41 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms