Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spag9Q58A65 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms