Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem171Q4KL18 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem171Q4KL18 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms