Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms