Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pfdn4Q3UWL8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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