Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms