Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms